Seminars
Výpočet a zobrazení dutin v molekuláchWritten by Martin Maňák Martin Maňák
University of West Bohemia
Seminar in Czech May 28, 2013 at 11:00 University of West Bohemia, UK417
Abstract
Na semináři si ukážeme algoritmus výpočtu a zobrazení analytického povrchu dutin v molekulách. Model povrchu molekuly hraje významnou roli při analýze volného prostoru v proteinech. Tento model se skládá z částí sférických a toroidálních plátů a jeho podoba závisí na uživatelském parametru - poloměru sondy. Postupy výpočtu jsou sice známy již od roku 1971, ale jejich efektivita klesá s rostoucím poloměrem sondy.
Náš algoritmus využívá aditivně-váženého Voronoi diagramu, což mu dovoluje efektivní konstrukci povrchu i pro velké poloměry sondy. Podobné řešení již několik let úspěšně propaguje korejská výzkumná skupina VDRC. Naše řešení ale zvládne i velké molekuly a dokáže pracovat s jednotlivými dutinami samostatně. [ Back ]
|
|
Copyright © 2013 Centre of Computer Graphics and Visualization. All Rights Reserved.